Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Fernanda Hernandez graduada y Pablo Castillejos y  Carlos Bastidas  docentes de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Las bacterias multirresistentes presentan mecanismos de resistencia frente a los antibióticos β-lactámicos, como las enzimas betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y metalo-β-lactamasas (MBL), que son operones codificados en especies gramnegativas. Asimismo, las bacterias Gram-positivas han desarrollado otros mecanismos a través de los genes mec, que codifican proteínas fijadoras de penicilina modificadas (PBP2).

Este estudio tuvo como objetivo determinar la presencia y propagación de genes de resistencia a antibióticos β-lactámicos y el microbioma que circula en el Transporte Público de Quito (QTP). Se tomaron muestras de un total de 29 torniquetes de estación para extraer el ADN ambiental de la superficie. Se realizaron PCR para detectar la presencia de 13 genes de resistencia a antibióticos y para identificar y amplificar 16S rDNA para códigos de barras, seguido de análisis de clones, secuenciación de Sanger y búsqueda BLAST. Los genes ESBL blaTEM-1 y blaCTX-M-1 y los genes MBL blaOXA-181 y mecA se detectaron a lo largo de las estaciones QPT, siendo blaTEM el más extendido. Se encontraron dos subvariantes para blaTEM-1, blaCTX-M-1 y blaOXA-181.

Casi la mitad de las bacterias circulantes encontradas en las estaciones QPT eran especies comunes de microbiota humana, incluidas las clasificadas por la OMS como patógenos de vigilancia crítica y de alta prioridad. Los genes de resistencia a los antibióticos β-lactámicos prevalecen en todo el QPT. Este es el primer reporte de blaOXA-181 en muestras ambientales en Ecuador. Además, detacteraon una nueva variante putativa de este gen. Algunas bacterias coagulasa negativas comensales pueden desempeñar un papel como reservorios de resistencia a mecA.

El artículo se titula: “Beta-Lactam Antibiotic Resistance Genes in the Microbiome of the Public Transport System of Quito, Ecuador”

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Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Paula Huilca, Salomé Guerrero,  Yanua Ledesma y David Vasco graduados y Pablos Castillejos y  Carlos Bastidas  docentes de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

El género Prototheca, una microalga unicelular, no fotosintética, parecida a una levadura, es un patógeno de preocupación para la industria láctea. Provoca una mastitis bovina que en la actualidad no tiene cura, por lo que genera importantes pérdidas económicas en la producción de leche. En este estudio, por primera vez en Ecuador, se identificó a Prototheca bovis como el agente etiológico de mastitis crónica en ganado lechero. Se cultivaron muestras de leche de vacas con mastitis crónica en SDA.

Se utilizó microscopía y secuenciación del gen cytB para identificar Prototheca, por lo que se aisló Prototheca bovis del 15,1%  de las muestras de leche, una de las tasas de infección más altas que se pueden encontrar en la literatura en una situación “sin brote”.  No se encontraron otras especies de Prototheca. No se pudo aislar el alga de las muestras ambientales.

Se mostró que P. bovis era relativamente resistente a los desinfectantes utilizados para esterilizar el equipo de ordeño en las fincas ganaderas donde se aisló. Se discutió cómo evitar futuras infecciones y también planteamos la hipótesis de que la prevalencia real de la infección por Prototheca en la mastitis bovina es probablemente mucho mayor que la detectada. Se recomienda un protocolo para aumentar el rendimiento diagnóstico en el laboratorio de bacteriología.

El artículo se titula: “High Prevalence of Prototheca bovis Infection in Dairy Cattle with Chronic Mastitis in Ecuador”

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Invitación Seminario Nacional “Jóvenes Científicos”

La Sociedad de Ingeniería en Medicina y Biología de la Universidad de las Américas presentan el I Congreso Nacional Jovenes Científicos, el cual tiene como objetivo dar a conocer investigaciones dentro de las distintas área de la biotecnología ademas de fomentar un entorno de intercambio de conocimientos entre estudiantes y profesionales de Ecuador.

😷 ➡ Evento Gratuito, con derecho a certificado de asistencia.

🕑HORA: 8:30 am

📆 FECHA: Viernes 16 de Diciembre

📌 LUGAR: Universidad de las Américas, Auditorio 2

Inscripciones: 🔗https://forms.gle/xctvjsrmsDVQw16A7

 

 

 

 

Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Juan Ochoa y Carlos Moyota graduados y Maria Isabel Baroja, Carlos Bastidas y Wilson Tapia docentes de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

La contaminación fecal en las fuentes naturales de agua es un problema común en los países de bajos ingresos. Varios riesgos para la salud están asociados con fuentes de agua sin protección, como infecciones gastrointestinales causadas por parásitos, virus y bacterias. Además, las bacterias resistentes a los antibióticos en las fuentes de agua se han convertido en un problema creciente en todo el mundo.

Este estudio tuvo como objetivo evaluar los patógenos bacterianos presentes en el agua dentro de un contexto rural en Ecuador, junto con la eficiencia de los filtros de agua de cerámica negra (BCWF) como un tratamiento de agua doméstico sostenible. Se monitoreo cinco fuentes de agua natural que se usaban para consumo humano en las tierras altas de Ecuador y analizamos los coliformes totales y E. coli antes y después de la instalación de BCWF. Los resultados indicaron una contaminación bacteriana variable (29-300 unidades formadoras de colonias/100mL) en todas las muestras sin filtrar, y se consideraron de alto riesgo para el consumo humano, pero después de la filtración no se encontraron bacterias.

Además, se detectaron E. coli productoras de betalactamasas de espectro extendido con genes blaTEM, blaCTX-M9 y blaCTX-M1, y dos E. coli clasificadas en el complejo clonal ST10 (ST98) en dos de las localidades muestreadas; estas cepas pueden afectar gravemente la salud pública. El complejo clonal ST10, que se encuentra en los aislados de E. coli, posee el potencial de propagar genes resistentes a bacterias a humanos y animales.

Los resultados del uso de BCWF, sin embargo, argumentan a favor del impacto potencial de los filtros dentro de esos contextos, ya que los BCWF eliminaron por completo incluso los contaminantes resistentes a los antibióticos del agua.

El artículo se titula: “Removal of Extended-Spectrum Beta-Lactamase-Producing Escherichia coli, ST98, in Water for Human Consumption by Black Ceramic Water Filters in Low-Income Ecuadorian Highlands”

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Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Ana Angulo, Alejandra Garzón y Rodrigo Flores graduados de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Los continuos eventos de mestizaje entre europeos, nativos americanos y africanos ocurrieron de manera diferente a lo largo del territorio ecuatoriano, creando una composición genética diversificada. Por lo tanto, para evaluar cómo se reparte la diversidad genética a lo largo del país para 15 ROS, se analizaron 842 muestras de población mixta.

También evaluaron el efecto de aplicar un ajuste por estructura de población al estimar los LR utilizando una base de datos nacional. Los resultados mostraron que para evaluar con precisión la evidencia forense, el uso de una base de datos nacional puede estar justificado con la aplicación de un ajuste apropiado para la estructura de la población.

El artículo se titula: “Evaluating population structure of Ecuador for forensic STR markers

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Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Ignacio Yepez, Alejandra Garzón y Rodrigo Flores graduados de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

El presente estudio tuvo como objetivo caracterizar la composición genética paterna de la población indígena ecuatoriana. Para investigar un posible sesgo de matización, también se analizaron AIM-InDels. La muestra poblacional de 54 autodeclarados indígenas ecuatorianos presentó una alta diversidad de haplotipos.

Una gran proporción de los linajes masculinos pertenecen a haplogrupos de nativos americanos. Aunque de origen autodeclarado indígena, la muestra poblacional estudiada presentó una baja distancia genética con una muestra de individuos mestizos del Ecuador..

El artículo se titula: “The paternal heritage of self-declared Ecuadorian indigenous people

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Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Katherin Barrionuevo, Alejandra Garzón, graduadas y Eduardo Tejera docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Encontrar estrategias rápidas y baratas para la tipificación de ADN y la identificación de muestras humanas es de interés en la ciencia forense. En este trabajo se presenta una nueva alternativa versátil para la determinación del sexo molecular utilizando objetivos específicos de Y (TSPY, TTTY, regiones alfoides y Y-Amelogenina). Este sistema utiliza una amplificación de ADN mediada por bucle isotérmico (LAMP) con un conjunto de 6 cebadores para cada objetivo, diseñado para mejorar la sensibilidad y la especificidad, y reducir el tiempo de detección a solo 45 min. Además, la detección de los diferentes objetivos en el cromosoma Y, ya sea individualmente o en combinación, reveló resultados precisos.

La sensibilidad del ensayo se determinó con una mezcla de ADN humano femenino y masculino a diferentes concentraciones para imitar las muestras forenses. Los conjuntos de cebadores individuales mostraron una alta sensibilidad a concentraciones de ADN que oscilaban entre 58,6 y 3,7 pg/µL. Cuando se utilizó un conjunto de cebadores combinados, la sensibilidad arrojó una detección tan baja como 0,1 pg/µL de ADN masculino, lo que lo hace 10 veces más sensible que los kits de cuantificación de qPCR-DNA.

Finalmente, se observó una alta especificidad cuando se probó contra 6 especies domésticas.

El artículo se titula: “High-performance LAMP-based method for human sex identification using Y chromosome-specific genetic markers

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Oportunidad de Pasantías

Se solicitan dos pasantes para el Grupo de Bio-quimioinformática. El tema de trabajo es la identificación de los posibles mecanismos de acción de alcaloides presentes en especies de ranas venenosas. El proyecto es completamente computacional y trabajarán con los profesores Yunierkis Pérez y Yendrek Velásquez.

Requisitos:

  • Estar en 4to semestre o superior y como máximo estar iniciando 8vo semestre.
  • Conocimientos de bioquímica y preferiblemente haber cursado la materia de bioinformática.

En este proyecto aprenderás sobre bioinformática estructural, estructura de proteínas, interacciones proteína-ligando, y sobre acoplamiento (docking) molecular.

Enviar Curriculum al correo: yendrek.velasquez.lopez@udla.edu.ec

Horarios 2023-1

Estimada Comunidad,

Para conocer los horarios 2023-1 definidos por la carrera de Ingeniería en Biotecnología en todos los semestres, por favor revisen el siguiente documento:

Horarios

Normativa para carga académico semestre 2023-1
1. Revisar la malla académica para verificar su avance. Esta se encuentra publicada en el blog de la carrera.
2. Antes de cargar las materias, verificar que cumple con los prerrequisitos.
3. Si toma materias de varios semestres, cargar primero las materias de los semestres inferiores.
4. Cargar la asignatura de inglés.
5. Si carga prácticas profesionales debe registrar 240 horas durante el semestre.
6. De presentarse algún inconveniente con la carga académica por favor acercarse a la universidad (Sede Udlapark: Coordinación de los laboratorios, Ala Este, Piso: –3) desde el día lunes 5 de septiembre, 9:30 y solicitar un turno a Lucy. Se atenderá en orden de llegada. Si es posible traer un borrador de horario.

Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Andrea Beltrán, Mabel Guevara y John Proaño graduados y Eduardo Tejera docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, publicaron su trabajo de investigación.

Ocimum basilicum y Ocimum tenuiflorum son dos especies de albahaca ampliamente utilizadas en medicina como agentes antiinflamatorio, antimicrobiano y cardioprotector. Este estudio se centra en la caracterización química de los compuestos mayoritarios de ambas especies y su potencial antiinflamatorio. En ambas plantas se identificaron hasta 22 compuestos como diversos tipos de ácidos salvianólicos, derivados del ácido rosmanírico y flavonas. Los compuestos identificados fueron muy similares entre ambas plantas y son consistentes con hallazgos previos en otros estudios en Portugal e Italia.

Sobre la base de las moléculas identificadas se llevó a cabo una predicción de objetivos de consenso. Entre las principales proteínas diana previstas, se encontró una alta representación de la familia de las anhidrasas carbónicas (CA2, CA7 y CA12) y varias proteínas clave de la vía araquidónica (LOX5, PLA2, COX1 y COX2). Ambas vías están bien relacionadas con la inflamación.

La interacción entre los compuestos y estos objetivos se exploró mediante acoplamiento molecular y simulación de dinámica molecular. Los resultados sugieren que algunas moléculas presentes en ambas plantas pueden inducir una respuesta antiinflamatoria a través de un mecanismo de acción no esteroideo relacionado con el metabolismo del dióxido de carbono.

El artículo se titula: ”Metabolomic profile and computational analysis for the identification of the potential anti-inflammatory mechanisms of action of the traditional medicinal plants Ocimum basilicum and Ocimum tenuiflorum

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