Nueva publicación de nuestros estudiantes en revista científica internacional

Alejandra Garzón, Kelly Maldonado y Camilo Ávila, estudiantes de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) de la Universidad, publicaron su trabajo de investigación en la editorial científica internacional Elsevier.

El estudio nos muestra que la población ecuatoriana está compuesta principalmente por mestizos, un grupo étnico cuyos orígenes se remontan a eventos de mezcla en los períodos postcolombinos, incluidos amerindios, europeos y africanos. Razón por la cual, es importante dilucidar su complejidad genética, aumentando así los registros ecuatorianos en bases de datos locales y globales, ayudando en futuros análisis forenses y estudios evolutivos.

En el estudio se analizaron 101 haplotipos de individuos varones mestizos autodeterminados mediante el sistema PowerPlex Y23. La asignación del haplogrupo fue evaluada comparando tres haplogrupos Y-STR en algoritmos de silico.

Noventa y nueve haplotipos fueron encontrados como únicos; por lo tanto, la diversidad de haplotipos para esta población fue 0.9998 +/− 0.0014. Mediante la predicción del haplogrupo encontramos linajes nativos (41%) y linajes no nativos americanos (59%). La comparación entre predictores mostró asignaciones de haplogrupos similares.

El artículo se titula: “A look of paternal ancestry in a sample of Ecuadorian “MESTIZO” population analyzed through PowerPlex Y23”

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Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Nueva publicación de nuestros estudiantes en revista científica internacional

Kelly Maldonado, estudiante de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) de la Universidad, publicó su trabajo de investigación en la editorial científica internacional Elsevier.

El estudio nos muestra que las leyes colombianas requieren que los valores de probabilidad de prueba de paternidad sean superiores al 99,99% para probar la relación biológica. El laboratorio IdentiGEN actualmente usa 23 marcadores genéticos autosómicos incluidos en los kits comerciales Identifiler®, PowerPlex®16, FFFL® y Triplex®; sin embargo, en algunos casos complejos, el número de marcadores no es suficiente para alcanzar el umbral estadístico legal.

El kit IdentiPLEX, que consta de 19 marcadores, seleccionados de las bases de datos NIST y STRbase, fue desarrollado y validado de acuerdo con los requisitos establecidos por la norma NTC-ISO17025. Estos incluyen, entre otros, estudios de precisión, especificidad, sensibilidad, proporción de tartamudeo y pruebas de concordancia.

Los parámetros forenses y de población también se calcularon utilizando Powerstats y el software Arlequin V3.5.2. Estos análisis permitieron concluir que el kit identiplex es apropiado para el trabajo de casos de análisis de rutina, y más específicamente para resolver casos criminales y de filiación complejos.

El artículo se titula: “IdentiPLEX: A new STR kit for human identification developed and validated at IdentiGEN laboratory in Colombia”

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Nueva publicación de nuestros estudiantes en revista científica internacional

Camilo Ávila, estudiante de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) de la Universidad, publicó su trabajo de investigación en la editorial científica internacional Elsevier.

El estudio nos muestra que la prueba de ADN es el estándar de oro para la filiación biológica y la identificación humana, basada principalmente en una gran cantidad de polimorfismos de STR, que son causados principalmente por mutaciones relativamente frecuentes. Los cambios en el tamaño de los alelos en las secuencias STR se asocian frecuentemente con estas mutaciones, causando alteraciones en los cálculos estadísticos de las pruebas, lo que reduce el índice de paternidad (PI). Para evitar tales alteraciones y obtener una probabilidad de paternidad (W) superior al 99,99%, es necesario aumentar el número de RTS analizados y conocer la frecuencia de aparición de estas mutaciones.

En el presente estudio, se analizaron 17 STR en un total de 11,077 casos, según los informes de paternidad emitidos por el Laboratorio IdentiGEN, centrados principalmente en la población de Antioquia, durante 14 años (2005–2018).

Se encontraron un total de 251 mutaciones en todos los casos estudiados; de estos, 247 fueron mutaciones de un paso, 3 fueron de dos pasos y solo se observó una mutación de tres pasos.

El artículo se titula: “An update of STR mutation rates from paternity tests analyzed in a 14 year period (2005–2018) at IdentiGEN lab, Universidad de Antioquia, Colombia”

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Nueva publicación de nuestros graduados en revista científica internacional

Rodrigo Flores, graduado de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) de la Universidad, publicó su trabajo de investigación en la editorial científica internacional Elsevier.

El estudio efectuado nos muestra que la resina Chelex ha sido desarrollada y ampliamente utilizada para extraer ADN de diferentes muestras de tipo forense. Sin embargo, ningún estudio ha demostrado la conservación de las muestras extraídas a lo largo del tiempo en muestras de hisopos bucales y sangre en tarjetas FTA.

Para este estudio se probaron tres métodos de extracción de ADN: Chelex 10% -Proteinase K (CHK), Phenol Chloroform (PC) y Chelex 10% -Proteinase K purified with Phenol Chloroform (CHK + PC) en dos tipos diferentes de muestras: sangre almacenado sobre tarjetas FTA y muestras de hisopos bucales.

El gen de beta-actina (136 pb) se amplifica por PCR a los 0, 4 y 8 meses, los perfiles de STR y la amplificación del ADN mitocondrial (1200 pb) se realizaron a los 15 meses para verificar la calidad del ADN. Estos resultados sugieren la importancia de elegir el método de extracción de ADN que garantice la conservación de muestras de ADN forenses o de referencia para futuros estudios o pruebas forenses.

El artículo se titula: “Efficient preservation of DNA extracted from blood in FTA cards by Chelex method”

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Nueva publicación de nuestros graduados en revista científica internacional

Rodrigo Flores, José Yépez, y Alejandra Garzón, graduados de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) de la Universidad, publicaron su trabajo de investigación en la editorial científica internacional Elsevier.

El estudio efectuado demostró que el análisis de ADN mitocondrial se presenta como una herramienta poderosa para estudiar la herencia materna entre las poblaciones. También es útil inferir el origen geográfico y las relaciones entre individuos y muestras de población.

Los resultados obtenidos, mostraron que alrededor del 96% de los individuos analizados tenían linajes maternos nativos americanos. Según las distancias genéticas, Ecuador mostró diferencias significativas con otras poblaciones de América del Sur, excepto en la comparación con otra muestra de mestizos ecuatorianos, como se esperaba.

 

El artículo se titula: “An approach to maternal ancestry in a sample of Ecuadorian “mestizo” population by sequencing the control region of mtDNA”

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