Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Katherin Barrionuevo, Alejandra Garzón, graduadas y Eduardo Tejera docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Encontrar estrategias rápidas y baratas para la tipificación de ADN y la identificación de muestras humanas es de interés en la ciencia forense. En este trabajo se presenta una nueva alternativa versátil para la determinación del sexo molecular utilizando objetivos específicos de Y (TSPY, TTTY, regiones alfoides y Y-Amelogenina). Este sistema utiliza una amplificación de ADN mediada por bucle isotérmico (LAMP) con un conjunto de 6 cebadores para cada objetivo, diseñado para mejorar la sensibilidad y la especificidad, y reducir el tiempo de detección a solo 45 min. Además, la detección de los diferentes objetivos en el cromosoma Y, ya sea individualmente o en combinación, reveló resultados precisos.

La sensibilidad del ensayo se determinó con una mezcla de ADN humano femenino y masculino a diferentes concentraciones para imitar las muestras forenses. Los conjuntos de cebadores individuales mostraron una alta sensibilidad a concentraciones de ADN que oscilaban entre 58,6 y 3,7 pg/µL. Cuando se utilizó un conjunto de cebadores combinados, la sensibilidad arrojó una detección tan baja como 0,1 pg/µL de ADN masculino, lo que lo hace 10 veces más sensible que los kits de cuantificación de qPCR-DNA.

Finalmente, se observó una alta especificidad cuando se probó contra 6 especies domésticas.

El artículo se titula: “High-performance LAMP-based method for human sex identification using Y chromosome-specific genetic markers

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Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Sara de la Cruz, Michelle Rojas, Génesis Salazar graduadas y Pablo Castillejos docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

El estudio, persiguió la detección de los genes cyr y mcy para evaluar la presencia de cilindrospemopsina (CN) y microcistina (MC) productores potenciales en cuerpos de agua ecuatorianos. Se extrajeron ADN ambiental (eDNA) de ocho cuerpos de agua y una planta de tratamiento de aguas residuales (PTAR) de Ecuador. Se diseñó una PCR anidada para amplificar los genes mcyB, cyrE y cyrJ en estas muestras ambientales. Los productos de PCR se secuenciaron y contrastaron con la base de datos GenBank.

Se encontraron productores potenciales de CN en siete cuerpos de agua y la PTAR. La amplificación de cyrE reveló tres variantes pertenecientes a las especies Raphidopsis y Aphanizmenon y una para cyrJ con alrededor del 90 % de identidad con las especies Raphidiopsis y Oscillatoria. Cuatro cuerpos de agua presentaron la misma variante para mcyB similar a Microcystis panniformis con 99% de identidad.

Este estudio aporta nuevos datos sobre la presencia de cepas de cianobacterias tóxicas y proporciona nuevas herramientas moleculares para evaluar los peligros de las cianotoxinas en los cuerpos de agua ecuatorianos.

El artículo se titula: “Screening of cyanotoxin producing genes in Ecuadorian freshwater systems

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