Isabel Baroja e Ivan Moya docentes de Ingeniería en Biotecnología, publicaron su trabajo de investigación.

La hiperactivación de YAP/TAZ y los efectores posteriores de la vía del hipopótamo, son comunes en el cáncer humano. La necesidad de YAP/TAZ para la supervivencia de las células cancerosas en modelos preclínicos impulsó el desarrollo de inhibidores farmacológicos que suprimen su actividad transcripcional. Sin embargo, la inhibición sistémica de YAP/TAZ a veces puede tener resultados impredecibles para los pacientes, con efectos limitados o incluso adversos porque la acción de YAP/TAZ no es simplemente promotora de tumores sino también supresora de tumores en algunos tipos de células.

Aquí,  se revisa el papel de la vía del hipopótamo en distintas poblaciones de células tumorales, analizando el impacto de la inhibición de la producción del hipopótamo en el crecimiento del tumor y examinando los desarrollos actuales en los inhibidores de YAP/TAZ.

El artículo se titula:“Expected and unexpected effects after systemic inhibition of Hippo transcriptional output in cancer”

Para poder conocer todos los resultados obtenidos, haga clic aquí.

Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Vinicio Armijos docente de Ingeniería en Biotecnología, publicó su trabajo de investigación.

La trehalosa 6-fosfato (Tre6P), el intermediario de la biosíntesis de trehalosa, es un metabolito de señalización esencial que vincula el crecimiento y desarrollo de las plantas con el metabolismo del carbono. Si bien el trabajo reciente se ha centrado predominantemente en las enzimas que producen Tre6P, se sabe poco sobre las proteínas que catalizan su degradación, las trehalosa 6-fosfato fosfatasas (TPP). Los TPP, que a menudo se encuentran en grandes familias de proteínas, exhiben patrones de expresión específicos de células, tejidos y etapas de desarrollo, lo que sugiere funciones reguladoras importantes en el control de los niveles locales de Tre6P y trehalosa, así como la señalización de Tre6P. Además, cada vez hay más evidencia a través de estudios de expresión genética y enfoques transgénicos que muestran que los TPP desempeñan un papel importante en la integración de las señales ambientales con el metabolismo de las plantas. Esta revisión destaca la gran diversidad de isoformas de TPP en plantas modelo y de cultivo e identifica cómo la modulación del metabolismo de Tre6P en ciertos tipos de células, tejidos y en diferentes etapas de desarrollo puede promover la tolerancia al estrés, la resiliencia y un mayor rendimiento de los cultivos.

El artículo se titula:“The trehalose 6-phosphate phosphatase family in plants”

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Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Biotecnología Aplicada

Se abre la convocatoria para prácticas pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-2.

Los requisitos son los siguientes:

• Carta de intención
• Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en la materia de Microbiología I y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
• CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo wilson.tapia@udla.edu.ec y maria.cruz.salazar@udla.edu.ec con copia a carlos.moyota.tello@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el viernes 16 de febrero, 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Biotecnología Vegetal

Se abre la convocatoria para pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestres 2024-2,2025-1.

Los requisitos son los siguientes:

• Carta de intención
• Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en la materia de Fisiología Celular y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
• CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo fernando.rivas@udla.edu.ec con copia a carlos.moyota.tello@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el viernes 16 de febrero, 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Biotecnología Industrial

Se abre la convocatoria para pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestres 2024-2,2025-1.

Los requisitos son los siguientes:

• Carta de intención
• Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en la materia de Biotecnología Enzimática y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
• CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo maria.cruz.salazar@udla.edu.ec con copia a carlos.moyota.tello@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el viernes 16 de febrero 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Biotecnología Molecular

Se abre la convocatoria para pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-2.

Los requisitos son los siguientes:

• Carta de intención
• Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en la materia de Biología Molecular I y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
• CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo maria.baroja@udla.edu.ec con copia a carlos.moyota.tello@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el viernes 16 de febrero, 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Pablo Viteri graduado, Vinicio Armijos y  Eduardo Tejera docentes de Ingeniería en Biotecnología,  publicaron su trabajo de investigación

Los estudios de la evolución de fenotipos antidepredadores, como las señales aposemáticas, han resultado informativos para demostrar el papel de la selección en la divergencia fenotípica. Oophaga pumilio muestra una gran variación en ambos elementos de sus señales aposemáticas; señales visuales que consisten en patrones de color, así como sus defensas químicas alcaloides donde una rana individual puede poseer docenas de tipos de alcaloides. Por lo tanto, desenredar la función de los alcaloides individuales es complicado debido a los diversos modos de defensas químicas, lo que dificulta las comparaciones simples entre los niveles de “toxicidad” relativa entre poblaciones hasta que podamos dilucidar las capacidades defensivas de los alcaloides.

En este estudio se ha modelado la afinidad de unión de los alcaloides más abundantes que se encuentran en poblaciones divergentes de O. pumilio descubriéndose que tenía una alta afinidad por unirse con los receptores muscarínicos de acetilcolina en varias clases de depredadores potenciales. Los experimentos de interacción molecular y acoplamiento indican que las interacciones entre los receptores alcaloides y muscarínicos están altamente conservadas, y los propios receptores muscarínicos muestran evidencia de una fuerte selección purificadora. Por lo tanto, predecimos que la redundancia funcional es plausible entre los alcaloides más comunes frente a objetivos comunes, y es probable que estos alcaloides funcionen de manera similar en diversos conjuntos de depredadores. Esto proporciona una base predecible de defensas para esta combinación de alcaloides y receptores entre poblaciones divergentes que varían en señales aposemáticas.

El artículo se titula:“Modeling defensive functions of alkaloids within diverse chemical portfolios”

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Andrea Beltran, Mabel Guevara graduadas y Eduardo Tejera docente de Ingeniería en Biotecnología,  publicaron su trabajo de investigación

Ocimum se considera el género más grande de la familia Lamiacea. El género incluye la albahaca, un grupo de plantas aromáticas con una amplia gama de usos culinarios que hoy en día llama la atención por su potencial medicinal y farmacéutico. Esta revisión sistemática tiene como objetivo explorar la composición química de los aceites no esenciales y su variación entre diferentes especies de Ocimum. Además, el objetivo fue identificar el estado del conocimiento sobre el espacio molecular en este género, así como los diferentes métodos de extracción/identificación y ubicación geográfica.

Se seleccionaron setenta y nueve artículos elegibles para el análisis final, del cual extrajimos más de 300 moléculas. Encontrando que los países con mayor número de estudios sobre especies de Ocimum son India, Nigeria, Brasil y Egipto. Sin embargo, de todas las especies conocidas de Ocimum, sólo 12 tuvieron una caracterización química extensa, particularmente Ocimum basilicum y Ocimum tenuiflorum. Este estudio se centró especialmente en extractos alcohólicos, hidroalcohólicos y acuosos, en los que las principales técnicas para la identificación de compuestos son GC-MS, LC-MS y LC-UV. Entre las moléculas compiladas, encontraron una amplia variedad de compuestos, especialmente flavonoides, ácidos fenólicos y terpenoides, lo que sugiere que este género podría ser una fuente muy útil de posibles compuestos bioactivos. La información recopilada en esta revisión también enfatiza la enorme brecha entre la gran cantidad de especies de Ocimum descubiertas y la cantidad de estudios en cada una de ellas que determinaron la caracterización química.

El artículo se titula:“Exploring the Chemistry of Ocimum Species under Specific Extractions and Chromatographic Methods: A Systematic Review”

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Andrea Córdoba, Sofia Jimenes graduadas y Yasel Guerra docente de Ingeniería en Biotecnología,  publicaron su trabajo de investigación

Durante décadas, las gorgonias y los corales blandos se han considerado fuentes prometedoras de compuestos bioactivos, lo que ha atraído el interés de científicos de diferentes campos. Como los compuestos bioactivos más abundantes dentro de estos organismos, los terpenoides, esteroides y alcaloides han recibido la mayor cobertura en la literatura científica. Sin embargo, los inhibidores de enzimas, una clase funcional de compuestos bioactivos con un alto potencial para la industria y la biomedicina, han recibido mucha menos notoriedad.

Así, se ha revisado la literatura científica (1974-2022) en el campo de los productos naturales marinos en busca de inhibidores enzimáticos aislados de estos grupos taxonómicos. En esta revisión, se presentan inhibidores enzimáticos representativos desde una perspectiva enzimológica, destacando, cuando estén disponibles, datos sobre objetivos, estructuras, potencias, mecanismos de inhibición y funciones fisiológicas específicas de estas moléculas. Como la mayoría de los estudios de caracterización de los nuevos inhibidores siguen incompletos, también se incluye una sección metodológica que presenta una estrategia general para afrontar este objetivo mediante el cumplimiento de las directrices del proyecto STRENDA (Standards for Reporting Enzymology Data).

El artículo se titula:”Enzyme Inhibitors from Gorgonians and Soft Corals”

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Vinicio Armijos, Eduardo Tejera y Yasel Guerra docentes de Ingeniería en Biotecnología,  publicaron su trabajo de investigación.

La familia de inhibidores de tripsina de soja Kunitz (Kunitz-STI) es una gran familia de proteínas y la mayoría de sus miembros son inhibidores de proteasa. La versatilidad del perfil inhibidor y la plasticidad estructural de estas proteínas hacen de esta familia un andamio prometedor para el diseño de nuevas proteínas multifuncionales. Históricamente, los inhibidores de Kunitz-STI se han clasificado como inhibidores canónicos de serina proteasa, pero en los últimos años se han descrito nuevos inhibidores con nuevos mecanismos de inhibición. Diferentes mecanismos de inhibición podrían ser el resultado de diferentes vías evolutivas. En el presente trabajo, se ha realizado un análisis estructural de todas las estructuras cristalográficas disponibles para los inhibidores de Kunitz-STI para caracterizar las características y ubicaciones estructurales del bucle de unión de serina proteasa.

El estudio sugiere una relación entre la conformación de los bucles de unión de serina proteasa y el mecanismo de inhibición, su ubicación en el pliegue del trébol β y la fuente vegetal de los inhibidores. Los inhibidores canónicos clásicos de esta familia están restringidos a plantas del orden Fabales y se unen a sus objetivos a través del bucle β4-β5, mientras que los bucles de unión a serina proteasa en inhibidores de otras plantas se encuentran principalmente en los bucles β5-β6 y β9-β10. Además, se encontró que el bucle β5-β6 se utiliza para inhibir dos familias diferentes de serina proteasas a través de un mecanismo de inhibición del bloqueo estérico. Este trabajo ayudará a cambiar la percepción general de que todos los inhibidores de Kunitz-STI son inhibidores canónicos y las proteínas con bucles de unión a proteasas que adoptan conformaciones no canónicas son excepciones. Además, estos resultados ayudarán en la identificación de bucles de unión a proteasas en inhibidores no caracterizados o recientemente descubiertos, y en el diseño de proteínas multifuncionales.

El artículo se titula: “Canonical or noncanonical? Structural plasticity of serine protease-binding loops in Kunitz-STI protease inhibitors”

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Sebastián Atarihuana, Jennifer Gallardo Condor y Rodrigo Flores Espinoza, graduados de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación

La deficiencia de glucosa-6-fosfato deshidrogenasa (G6PDd) es un trastorno ligado al cromosoma X que afecta a más de 400 millones de personas en todo el mundo. Los individuos con variantes moleculares asociadas con una actividad enzimática reducida son susceptibles al estrés oxidativo en los glóbulos rojos, lo que aumenta el riesgo de afecciones fisiopatológicas y toxicidad de los tratamientos antipalúdicos. A nivel mundial, la prevalencia de G6PDd varía entre las poblaciones. En consecuencia, este estudio tiene como objetivo caracterizar la distribución de G6PDd dentro de la población ecuatoriana y describir la distribución espacial de los casos de malaria reportados.

Se genotiparon variantes moleculares asociadas con G6PDd en 581 individuos de grupos étnicos afroecuatorianos, indígenas, mestizos y montubios. Además, se realizó un análisis espacial para identificar grupos importantes de malaria con altas tasas de incidencia en todo Ecuador, utilizando datos recopilados de 2010 a 2021.

Las variantes A- c.202G > A y A- c.968T > C sustentan la base genética de G6PDd en la población estudiada. La prevalencia general de G6PDd fue del 4,6% en toda la población. Sin embargo, esta frecuencia aumentó al 19,2% entre los afroecuatorianos. El análisis espacial reveló 12 grupos de malaria, ubicados principalmente en el norte del país y su región amazónica, con riesgos relativos de infección de 2,02 a 87,88.

Los hallazgos de este estudio tienen implicaciones significativas para las intervenciones de salud pública, las estrategias de tratamiento y los esfuerzos específicos para mitigar la carga de la malaria en Ecuador. La alta prevalencia de G6PDd entre los grupos afroecuatorianos en las áreas endémicas del norte requiere el desarrollo de estrategias integrales de erradicación de la malaria adaptadas a esta región geográfica.

El artículo se titula: “Genetic basis and spatial distribution of glucosa-6-phosphate dehydrogenase deficiency in Ecuadorian ethnic groups: a malaria perspective”

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Andres Ambuludí  graduado y Vinicio Armijos Docente de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

El síndrome respiratorio agudo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) es un virus emergente que, desde marzo de 2020, ha sido responsable de una pandemia global y en curso. Su rápida propagación durante los últimos tres años ha provocado la aparición de nuevas variantes. Para monitorear la circulación y aparición de variantes del SARS-CoV-2 se requieren sistemas de vigilancia basados en mutaciones de nucleótidos.

En este sentido, se ha buscado en los genes de pico, ORF8 y nucleocápside para detectar sitios variables entre las variantes del SARS-CoV-2. Describieron regiones genéticas polimórficas que nos permiten diferenciar entre las variantes preocupantes (VoC) Alfa, Beta, Gamma, Delta y Omicron. Encontrando 21 mutaciones relevantes, 13 de las cuales son únicas para los linajes Omicron BA.1/BA.1.1, BA.2, BA.3, BA.4 y BA.5. Este perfil genético permite la discriminación entre VoC utilizando solo cuatro fragmentos de PCR con transcripción inversa y secuenciación Sanger, ofreciendo una alternativa más barata y rápida a la secuenciación del genoma completo para la vigilancia del SARS-CoV-2.

El artículo se titula: “A tool for the cheap and rapid screening of SARS-CoV-2 variants of concern (VoCs) by Sanger sequencing”

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