Author Archives: Biotecnología

HORARIOS 2024-10

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Estimada Comunidad,

Para conocer los horarios 2024-10 definidos por la carrera de Ingeniería en Biotecnología en todos los semestres, por favor revisen el siguiente documento:

Carga-202410

Normativa para carga académica semestre 2024-10
  • Verificar que cumpla con los prerrequisitos de las materias que quiere tomar en el semestre 202410. Es responsabilidad de cada alumno conocer su avance de malla.
  • Cargar primero las materias de los niveles inferiores.
  • Cargar inglés (si lo tiene pendiente). En 4to semestre ya debería tener aprobada al menos la materia de INGZ0001.
  • Tomar en cuanta que los horarios pueden cambiar por motivos de fuerza mayor.
  • Los cursos que no cumplan con el mínimo de estudiantes serán cerrados.
  • Las materias de TITA7441 y TITA0692 no se proyectarán hasta que los trabajos sean aprobados por el Comité de Integración Curricular. Los estudiantes deben cargar las materias en los paralelos que se les asigne.
  • La materia de Prácticas Pre Profesionales (IBIO3718) solo se podrá cargar en caso de poder cumplir las 240 horas durante el semestre. No se proyectará la materia si no se ha realizado del proceso de pre-aprobación. Tomar en cuenta que las prácticas deben ser realizadas en temas afines a Biotecnología.
  • En caso de problemas en la carga por favor escribir a: andrea.cordero@udla.edu.ec detallando claramente el inconveniente e incluir el código Banner. Sin esta información no se procesará ninguna solicitud.

Nueva publicación de nuestros graduados en revista científica internacional

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David Vasco Julio, graduado de Biotecnología y Carlos Bastidas Caldéz, docente de Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

La histoplasmosis es una micosis endémica en las Américas. Sin embargo, su diagnóstico es un desafío debido a la complejidad y la disponibilidad limitada de técnicas de laboratorio convencionales: pruebas de antígenos, cultivo y tinción. Las preparaciones microscópicas suelen confundirse con otros patógenos, como Leishmania spp. El género Histoplasma capsulatum comprende tres variedades: var. capsulatum , var. duboissi y var. farciminosum, que no se puede distinguir utilizando técnicas convencionales. Un bebé de una región tropical de Ecuador fue hospitalizado por fiebre, diarrea con sangre y anemia que persistió durante dos meses. Al ingreso recibió antibióticos e inmunosupresores. 

El examen histopatológico de ganglios linfáticos, intestinos y aspirado de médula ósea informó la presencia de amastigotes similares a Leishmania y se inició tratamiento con antimoniato de meglumina y anfotericina B convencional. Sin embargo, el análisis posterior de las muestras mediante PCR y secuenciación de ADN identificó H. capsulatum var. . capsulatum pero no Leishmania. A pesar del fluconazol y la anfotericina B, el bebé sucumbió a la enfermedad. El retraso en el diagnóstico clínico y de laboratorio de la histoplasmosis y el uso de fármacos inespecíficos e ineficaces como el fluconazol provocaron la diseminación de la enfermedad y, en última instancia, la muerte. Es crucial implementar diagnóstico molecular y pruebas de antígenos en laboratorios ubicados en regiones endémicas y hospitales de referencia.

El artículo se titula: “A Fatal Case of Disseminated Histoplasmosis by Histoplasma capsulatum var. capsulatum Misdiagnosed as Visceral Leishmaniasis—Molecular Diagnosis and Identification”

Para poder conocer todos los resultados obtenidos, haga clic aquí.

Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Nueva publicación de nuestros graduados en revista científica internacional

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David Vasco Julio, María Huilca Ibarra, Yanua Ledesma y  Salome Guerrero Freire graduadas de Biotecnología y Carlos Bastidas Caldéz, docente de Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Se ha desarrollado un sistema de PCR múltiple (m-PCR) para diferenciar con precisión las cinco especies patógenas de Prototheca más importantes , incluidas las tres especies asociadas con la infección en el ganado lechero ( P. ciferrii , P. blaschkeae y P. bovis ) y las dos especies asociadas con infecciones humanas ( P. wickerhamii y P. cutis ). El método es de bajo costo ya que emplea un método simple de “choque térmico” en un tampón TE para la extracción de ADN. Además, solo requiere cebadores, una polimerasa Taq, un gel de agarosa y un marcador de peso molecular para su identificación.

El método se basó en la publicación Prototheca.secuencias del citocromo B y se evaluó utilizando cepas de referencia de cada una de las cinco especies de Prototheca . La validez del método se confirmó mediante la identificación de 50 cepas aisladas de muestras de leche. La especificidad se probó in silico y con pruebas experimentales de PCR, y no mostró reacciones cruzadas con otras especies de Prototheca , así como con bacterias, hongos, vacas, algas, animales o humanos. El método podría detectar infecciones mixtas que involucren a dos o tres especies de Prototheca , proporcionando una prueba rápida que arroja resultados en tres horas.

El artículo se titula: “The Development of a Multiplex PCR Assay for Fast and Cost-Effective Identification of the Five Most Significant Pathogenic Prototheca Species”

Para poder conocer todos los resultados obtenidos, haga clic aquí.

Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Convocatoria Pasantes

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Biotecnología Industrial

Se abre la convocatoria para pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-1 en la materia de Biotecnología Enzimática.

Los requisitos son los siguientes:

  • Carta de intención
  • Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en las materias de Química-Física y Biotecnología Enzimática y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
  • CV actualizado.

Las carpetas digitales serán receptadas al correo maria.cruz.salazar@udla.edu.ec con copia a carlos.moyota.tello@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el viernes  11 de agosto, 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Biotecnología Vegetal

Se abre la convocatoria para pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-1 con la en la materia de Biotecnología Vegetal.

Los requisitos son los siguientes:

  • Carta de intención
  • Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en la materia de Fisiología Celular y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
  • CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo fernando.rivas@udla.edu.ec con copia a carlos.moyota.tello@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el viernes 11 de agosto, 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Biotecnología Molecular

Se abre la convocatoria para pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-1 con la en la materia de Ingeniería Genética.

Los requisitos son los siguientes:

  • Carta de intención
  • Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en la materia de Ingeniería Genética y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
  • CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo carlos.moyota.tello@udla.edu.ec con copia a maria.granja@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el domingo 3 de septiembre, 5 pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Biotecnología Aplicada

Se abre la convocatoria para prácticas pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-1 con la en la materia de Proyecto Integrador.

Los requisitos son los siguientes:

  • Carta de intención
  • Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en las materias de Fenómenos de transporte aplicados a la Biotecnología y Bioestadística y al menos 8 en el promedio general de la carrera.
  • CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo carlos.moyota.tello@udla.edu.ec  y hasta el viernes 11 de agosto, 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Convocatoria Pasantes UITEC

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Unidad de innovación Tecnológica

Se abre la convocatoria para pasantías en el semestre 2024-1 en la unidad de innovación tecnológica

Los requisitos son los siguientes:

  • Carta de intención
  • Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener  al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
  • CV actualizado.

Las carpetas digitales serán receptadas al correo carlos.moyota.tello@udla.edu.ec con copia a mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el día viernes 14 de julio 10 am.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas, el 17  de julio.

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Antonella Zambrano y Emily Cisneros  graduadas y Carlos Bastidas Docentes de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Pocos estudios han abordado la farmacorresistencia de Enterobacterales en comunidades rurales de países en desarrollo. Este estudio tuvo como objetivo determinar la coexistencia de genes de β-lactamasa de espectro extendido (BLEE) y carbapenemasas en cepas de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae portadoras del gen mcr-1 en comunidades rurales de Ecuador de humanos sanos y sus animales de traspatio. Sesenta y dos cepas, treinta E. coli y treinta y dos cepas de K. pneumoniae portadoras del gen mcr-1 fueron seleccionadas de un estudio previo.

Se realizaron PCR para la presencia de ESBL y genes de carbapenemasas. Las cepas se caracterizaron aún más y la relación genética se estudió con la tipificación de secuenciación multilocus (MLST) de siete genes de mantenimiento. Cincuenta y nueve de los sesenta y dos aislamientos de mcr-1 (95%) albergaban al menos un gen de resistencia a β-lactámicos. Los genes ESBL más prevalentes fueron los genes blaTEM (presentes en el 80% de las cepas de E. coli) y el gen blaSHV (presente en el 84% de las cepas de K. pneumoniae). El análisis MSLT reveló 28 tipos de secuencia diferentes (ST); 15 para E. coli y 12 para K. pneumoniae, con la mayoría de las ST nunca descritas en humanos y animales. La coexistencia de genes resistentes a mcr-1 y β-lactámicos en cepas de E. coli y K. pneumoniae es alarmante y amenaza la eficacia de los antibióticos de último recurso. Nuestros hallazgos destacan a los animales de traspatio como un reservorio de genes resistentes a mcr-1/β-lactámicos.

El artículo se titula: “Co-Harboring of Beta-Lactamases and mcr-1 Genes in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae from Healthy Carriers and Backyard Animals in Rural Communities in Ecuador”

Para poder conocer todos los resultados obtenidos, haga clic aquí.

Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

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Melanie Cabezas y Emily Cisneros  graduadas y Carlos Bastidas Docentes de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Los perros que vagan libremente están altamente expuestos a una variedad de parásitos zoonóticos, incluidos los helmintos, que pueden transmitirse a los humanos, particularmente en entornos rurales tropicales de países en desarrollo. Para evidenciar la diversidad y prevalencia de helmintos gastrointestinales en las heces de perros en libertad en las playas públicas de la costa del Pacífico de Ecuador, se realizó un estudio transversal desde agosto de 2021 hasta agosto de 2022.

Las playas de muestreo están ubicadas a lo largo de la costa del Pacífico tropical. región. Las heces se recogieron del suelo en recipientes con formalina al 10% y se procesaron por el método de Ritchie; los huevos fueron identificados bajo un microscopio. Se examinaron un total de 573 heces de 20 playas; la prevalencia global fue de 157 (27,4%) para uno o más helmintos. Se identificaron diez parásitos, nueve de los cuales son potencialmente zoonóticos. Ancylostoma spp. fue el más prevalente (19,4%), seguido de Toxocara spp. (7,2%). Trichuris spp., Dipylidium caninum, Diphyllobothrium spp., Capillaria spp., Dicrocoelium spp., Heterobilharzia americana, Hymenolepis spp. y Spirocerca spp. también se observaron. Cinco de ellos son reportados por primera vez infectando perros en Ecuador.

Por lo tanto, se evidencio que las playas ecuatorianas están altamente contaminadas con los helmintos gastrointestinales zoonóticos de los perros, lo que representa un gran riesgo para la salud pública. Se encontraron diferencias en la presencia y prevalencia en muestras de zonas de clima tropical húmedo y seco. Por lo tanto, con base en nuestros hallazgos, se alienta la implementación de estrategias amplias de tratamiento y prevención antiparasitario para reducir el riesgo zoonótico.

El artículo se titula: “Diversity and prevalence of gastrointestinal helminths of free-roaming dogs on coastal beaches in Ecuador: Potential for zoonotic transmission”

Para poder conocer todos los resultados obtenidos, haga clic aquí.

Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

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Cristina Ramírez Córdova, Alisson Sarmiento Alvarado, María Belén Proaño, Isabel Camposano, Mishell Bravo Castro, Jean Franco Hidalgo, Dayana Coello y Daniela Arcos Suárez graduados , con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

El método de detección del estándar de oro del SARS-CoV-2 es una RT-qPCR con un paso previo de extracción de ARN viral de la muestra del paciente, ya sea mediante el uso de kits de extracción comerciales automatizados o manuales. Este paso de extracción de ARN es costoso y requiere mucho tiempo.

El objetivo del estudio fue evaluar el rendimiento clínico de un protocolo simple de detección de SARS-CoV-2 basado en una homogeneización de muestras rápida e intensa seguida de RT-qPCR directa.

En este estudio se analizaron 388 hisopos nasofaríngeos. 222 de ellos dieron positivo para SARS-CoV-2 por el método de extracción de ARN estándar dorado y RT-qPCR, mientras que 166 dieron negativo. 197 de esas 222 muestras positivas también dieron positivo para el protocolo de homogeneización, lo que arroja una sensibilidad del 88,74 % (95 % IC; 83,83 – 92,58). 166 de esas muestras negativas también resultaron negativas para el protocolo de homogeneización, por lo que la especificidad obtenida fue del 97% (95% IC; 93,11 – 99,01). Para valores de Ct por debajo de 30, lo que significa una carga viral de 103 copias/uL, solo 4 muestras positivas para SARS-CoV-2 fallaron para el método libre de extracción de ARN; para ese límite de detección, el método basado en homogeneizador tuvo una sensibilidad del 97,92 % (IC del 95 %; 96,01 – 99,83).

Estos  resultados muestran que este método de homogeneización rápido y económico para la detección de SARS-CoV-2 por RT-qPCR es una alternativa fiable y de alta sensibilidad para pacientes positivos para SARS-CoV-2 potencialmente infecciosos. Este protocolo sin extracción de ARN ayudaría a reducir el tiempo y el costo del diagnóstico, y a superar la escasez de kits de extracción de ARN experimentada durante la pandemia de COVID-19.

El artículo se titula: “Fast, cheap and sensitive: Homogenizer-based RNA extraction free method for SARS-CoV-2 detection by RT-qPCR”

Para poder conocer todos los resultados obtenidos, haga clic aquí.

Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Horarios 2023-20

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Estimada Comunidad,

Para conocer los horarios 2023-20 definidos por la carrera de Ingeniería en Biotecnología en todos los semestres, por favor revisen el siguiente documento:

Carga 202320

Normativa para carga académico semestre 2023-20

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David Vasco graduado y  Carlos Bastidas  docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

El virus de la estomatitis vesicular (VSV) es un arbovirus que causa estomatitis vesicular (VS) en el ganado. Hay dos serotipos reconocidos: New Jersey (VSNJV) e Indiana (VSIV). El virus puede transmitirse directamente por contacto o por vectores.

En 2018, Ecuador experimentó un brote de Estomatitis Vesicular (EV) en bovinos, causado por VSNJV y VSVIV, con 399 casos notificados distribuidos en 18 provincias. Se determinó las relaciones filogenéticas entre 67 cepas. Para la construcción de árboles filogenéticos se secuenció el gen de la fosfoproteína viral y se construyeron árboles con base en el método de Máxima Verosimilitud utilizando cepas del brote de 2004 de Ecuador (GenBank) y las secuencias de 2018 (este artículo). Se construyó una red de haplotipos para VSNJV para rastrear el origen de las epizootias de 2004 y 2018 a través de topologías y conexiones de mutación.

Estos análisis sugieren dos orígenes diferentes, uno relacionado con el brote de 2004 y el otro con una fuente de transmisión en 2018. Este análisis también sugiere diferentes patrones de transmisión; varios brotes pequeños e independientes, muy probablemente transmitidos por vectores en la Amazonía, y otro brote causado por el movimiento de ganado en las regiones andina y costera. Se recomienda más investigación sobre vectores y reservorios vertebrados en Ecuador para aclarar los mecanismos del resurgimiento del virus.

El artículo se titula: “Molecular Tracking of the Origin of Vesicular Stomatitis Outbreaks in 2004 and 2018, Ecuador”

Para poder conocer todos los resultados obtenidos, haga clic aquí.

Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.