Nueva publicación de nuestros graduados en revista científica internacional

Fernanda Hernández graduada y Pablo Castillejos docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI), publicaron su trabajo de investigación.

Los compuestos de fosfonato son la base de muchos contaminantes xenobióticos, como el glifosato (N- (fosfonometil-glicina). Solo los microorganismos procarióticos y los eucariotas inferiores son capaces de biodegradarse con fosfonatos a través de las vías de la C-P liasa.

Se determino la presencia de genes C-P liasa en los sistemas de agua dulce ecuatorianos como un primer paso hacia la evaluación de la presencia de degradadores de glifosato putativos, lo que rompe el enlace CP que es crítico para la mineralización del glifosato. Los ensayos diseñados en este estudio llevaron a la detección de genes phnJ en 7 de 8 cuerpos de agua analizados .

Los fragmentos amplificados presentaron un 85-100% de similitud de secuencia con genes phnJ que pertenecen a microorganismos degradadores de glifosato. Nueve secuencias no fueron reportadas previamente en el GenBank. La presencia de degradadores de fosfonatos se confirmó mediante el aislamiento de tres cepas capaces de gro w utilizando glifosato como fuente de carbono única. Según la secuencia 16S, estas cepas pertenecen a los géneros Pantoea, Pseudomonas y Klebsiella.

Realizar una amplificación por PCR anidada de genes phnJ aislados de cuerpos de agua eutroficados, antes del aislamiento, puede ser una estrategia rentable para la bioprospección de nuevas especies y / o genes que podrían tener nuevas propiedades para las industrias biotecnológicas, sentando las bases para investigaciones adicionales. .

El artículo se titula: “Bioremediation potential of glyphosate-degrading microorganisms in eutrophicated Ecuadorian water bodies

Para poder conocer todos los resultados obtenidos, haga clic aquí.

Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Convocatoria a practicas pre-profesionales con fines académicos

Denominación del puesto: Practicante

Dedicación: tiempo parcial / por horas

Remuneración: no disponible

Fecha de inicio: inmediato

Lugar: Pedro Pinto Guzman E7-390, Quito (sector: Pasteurizadora Quito, centro-sur).

Posibilidad de extensión o permanencia: si

Sobre la empresa:

BiologyWorks S.A.S. es una empresa recientemente constituida en la ciudad de Quito, dedicada al desarrollo, formulación, investigación y comercialización de insumos de base biotecnológica, cuya misión es proveer soluciones integrales al sector agroindustrial a través de la producción y comercialización de bioinsumos, que cumplan con los criterios de sostenibilidad en sus tres ejes: ambiente, economía y personas. Para ello, cuenta con un laboratorio de producción fundamentado en la investigación aplicada, en el cual el capital humano representa una parte esencial del proceso, por lo cual la formación profesional del personal y el establecimiento de colaboraciones son de gran interés.

 

Descripción de deberes y responsabilidades: 

Nota aclaratoria: La gran mayoría de actividades contarán con la dirección y ayuda del personal de la empresa

  • Tareas inherentes a la microbiología general, como elaboración de medios de cultivos, crecimiento en medios sólidos y líquidos, manejo de autoclave, entre otros.
  • Diseño, optimización e implementación de medios de cultivos utilizando modelos estadísticos
  • Desarrollo e implementación de protocolos de formulación a pequeña escala y a escala piloto.
  • Búsqueda e interpretación de información en publicaciones científicas
  • Manejo de inventarios y elaboración de informes
  • Mantener el orden y la limpieza general del laboratorio
  • Manejo de un biorreactor a escala piloto
  • Ejecución de trámites y elaboración de documentos para la acreditación y registro de productos ante diversas entidades de control
  • Escritura de artículos y presentación en congresos científicos

 

Requisitos:

  • Haber cursado y aprobado asignaturas relacionadas a: microbiología general, bioquímica y estadística (indispensable), redacción científica, bioprocesos y control de calidad (deseable, pero no indispensable).
  • Tener conocimiento en el manejo de equipos y materiales básicos de laboratorio
  • Motivación y perseverancia (indispensable).
  • Excelente capacidad de comunicación, tanto escrita como oral (artículos referenciados y elaboración de presentaciones).

 

Notas adicionales:

BiologyWorsk S.A.S. es una empresa que valora la publicación de resultados ante la comunidad científica. Sin embargo, dada la naturaleza empresarial, nos reservamos los derechos de uso y reproducción de material que sea considerado sensible. Por tal motivo, la empresa solicitará a la persona seleccionada la firma de un acuerdo de confidencialidad, previo al inicio de cualquier actividad de pasantía, práctica pre-profesional, o trabajo de titulación.

Nueva publicación de nuestros graduados en revista científica internacional

Solange Figueroa y Patricio Vega graduados de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Más de un año desde que el brote pandémico de la enfermedad por Coronavirus 2019 (COVID-19), la técnica estándar de oro para la detección del coronavirus 2 (SARS-CoV-2) del síndrome respiratorio agudo severo sigue siendo el RT-qPCR. Esta es una limitación para aumentar las capacidades de prueba, particularmente en los países en desarrollo, ya que se requieren reactivos y equipos costosos. Se desarollo una reacción de RT-PCR de punto final de dos pasos con el gen de la nucleocápside (N) del SARS-CoV-2 y cebadores específicos de la ribonucleasa P (RNasa P) en la que los amplicones virales se verificaron mediante electroforesis en gel de agarosa.

Se llevo a cabo una evaluación del rendimiento clínico y la sensibilidad analítica para este método de RT-PCR de punto final de dos pasos con 242 muestras nasofaríngeas utilizando el protocolo CDC RT-qPCR como técnica estándar de oro. Con una especificidad del 95,8%, una sensibilidad del 95,1% y un límite de detección de 20 copias de ARN viral / ul, este ensayo de RT-PCR de punto final de dos pasos es un método asequible y confiable para la detección del SARS-CoV-2. Este protocolo permitiría extender el diagnóstico de COVID-19 a los laboratorios de biología molecular básica con un potencial impacto positivo en los programas de vigilancia en los países en desarrollo.

El artículo se titula: “High sensitivity-low cost detection of SARS-CoV-2 by two steps end point RT-PCR with agarose gel electrophoresis visualization”

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Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Francisco Romero graduado y Carlos Bastidas docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Se reporta por primera vez el hospedador intermediario de caracol para la trematodiasis hepática Amphimerus, una trematodiasis transmitida por los alimentos. En Ecuador, Amphimerus de la familia Opisthorchiidae, infecta a humanos, gatos y perros en la región tropical de la costa del Pacífico. Los Opisthorchiidae, incluidos Clonorchis sinensis, Opisthorchis sp. Y Metorchis sp., Tienen ciclos de vida complejos que involucran un hospedador definitivo y dos intermediarios.

Fue identificado morfológicamente e investigamos la presencia y prevalencia de Amphimerus cercaria y ADN en caracoles de agua dulce recolectados en una región endémica de anfimeriasis humana en Ecuador, extrajimos ADN de tejido de caracol y cercarias emergidas, se realizó la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) en tiempo real con el nuevo desarrolló cebadores y sondas que amplifican la región del espaciador transcrito interno ribosómico 2 (ITS2) de Amphimerus, y secuenció el fragmento de ADN amplificado. Fueron recolectados 2.800 caracoles, cuatro especies distintas Aroapyrgus sp., Melanoides tuberculata, Biomphalaria cousini y Aplexa marmorata, aislaron tres morfotipos de cercarias. De los 640 caracoles analizados por qPCR, solo Aroapyrgus y una de las tres cercarias resultaron positivos, con una prevalencia de infección del 15%. La reacción en cadena de la polimerasa reveló que el caracol Aroapyrgus y el morfotipo cercaria-3 correspondían a Amphimerus, pero no a C. sinensis, Fasciola hepatica o Paragonimus mexicanus. La secuencia del producto de ADN amplificado coincidía con la de Amphimerus aislado en humanos.

Este hallazgo constituye la primera documentación que Aroapyrgus sp. es el primer hospedador intermedio de Amphimerus sp. que infecta a los humanos en Ecuador. La PCR del gen ITS2 y el análisis de secuenciación demostraron una alta prevalencia de infección por caracoles y resultaron útiles para detectar la infección en caracoles, hallazgos que pueden ayudar a establecer programas de control adecuados contra la transmisión en cualquier región endémica de interés.

El artículo se titula: “Molecular Identification of the Human Pathogen Amphimerus sp. in the Freshwater Snail Aroapyrgus sp. in Ecuador”

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Horarios 2022-1

Estimada Comunidad,

Para conocer los horarios 2022-1 definidos por la carrera de Ingeniería en Biotecnología en todos los semestres, por favor revisen el siguiente documento:

Horarios 2022-1

Requisitos para realizar la carga del semestre 2022-1:

  • Revisar las materias que debe tomar en el blog de la carrera (https://blogs.udla.edu.ec/biotecnologia/carrera/malla-academica/
  • Verificar que cumple con todos los prerequisitos de las materias que debe tomar.
  • Realizar la carga según el turno asignado y considerando los horarios publicados.
  • Cargar primero las materias de los semestres inferiores.
  • Es importante tomar la de materia de inglés. Para saber el nivel que deben tomar por favor comunicarse con el departamento de idiomas con el fin de agendar una cita sobre el examen de ubicación.
  • Los estudiantes que carguen IBIO3706 (prácticas pre profesionales) deben completar las horas de prácticas (96) durante el semestre, caso contrario reprobará la materia.
  • Cualquier inconveniente por favor escribir a los correos de Emilia Vásquez (emilia.vasquez@udla.edu.ec) / Andrea Cordero (andrea.cordero@udla.edu.ec), indicando claramente la situación junto con el ID Banner.

Saludos Cordiales,

Cursos de verano 2021

Estimada Comunidad,

Con respecto a los cursos de verano les comunico los siguiente:  

Fecha de inicio: martes 10 de agosto  
Fecha de fin: jueves 26 de agosto (excepto Inglés) 
Inscripción: El proceso seguirá siguiendo el mismo de años anteriores. Los estudiantes deberán registrarse con su coordinador/director académico, quien deberá validar si el estudiante puede o no inscribirse.
Número de estudiantes: El número mínimo de estudiantes para abrir un curso será de 8 personas.
Valores: Se mantendrán los valores del año anterior que ya incluía una beca de aproximadamente el 16%. Por lo que, el costo  para los cursos de verano  será de  USD$395. No se cobrará matrícula.

Formas de pago: Los estudiantes podrán realizar el pago hasta el viernes 13 de agosto a través de los siguientes canales:

👉Transferencia bancaria

1. Pueden realizar una transferencia desde el banco de su preferencia a:

Banco Pichincha, cuenta corriente # 3022819504.

Beneficiario: Universidad de Las Américas.

RUC: 1791362845001

2. Registrar su pago web, siguiendo el instructivo: https://bit.ly/3ceM0Oa

👉Pago en línea

✅ Ingresando al portal de pagos (con las tarjetas de crédito: Diners, Discover y Visa Titanium, puedes diferir su pago hasta 48 meses con intereses)➡ https://portalpagos.udla.edu.ec/

✅ Ingresando a Produbanco en línea ➡ https://bit.ly/2Wofxys
✅ Ingresando a Banco Pichincha en línea ➡ https://bit.ly/2EKoFqx

Pagos en efectivo o cheque a nivel nacional en agencias de Banco Pichincha y Produbanco.

Ciclo de Charlas Estudiantiles en Microbiología Aplicada

Estimada Comunidad,

Biotecnología UDLA es extiende la invitación al Ciclo de Charlas Estudiantiles en Microbiología Aplicada, nuestros estudiantes  tienen mucho que contarte al respecto. Conoce la Agenda.

AGENDA V2

Si quieres volver a verla, ingresa aquí:

Nueva publicación de nuestros graduados en revista científica internacional

Rodrigo Flores graduado  de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Según la historia demográfica, Ecuador ha experimentado cambios en sus poblaciones de nativos americanos causados ​​por la colonización europea y la trata de esclavos africanos. Los continuos eventos de mezcla entre europeos, nativos americanos y africanos ocurrieron de manera diferente en cada región del país, produciendo una población estratificada. Así, el objetivo de este estudio fue investigar el nivel de subestructura genética en la población mestiza ecuatoriana.

Se genotipificaron un total de 377 muestras masculinas y 209 femeninas para dos conjuntos de marcadores cromosómicos X (32 X-Indels y 12 X-STR). Los análisis de población realizados incluyeron pruebas de equilibrio de Hardy-Weinberg, análisis de LD, PCA, FST por pares y AMOVA.

Se observaron niveles significativos de LD entre marcadores separados por distancias de menos de 1 cM, así como entre marcadores separados por distancias que varían de 10,891 a 163,53 cM. Entre las regiones ecuatorianas, la Amazonia mostró el valor R2 promedio más alto.

Cuando se compararon los valores de diferenciación cromosómica X y autosómica, se reveló una mezcla de sesgo sexual entre hombres europeos y mujeres nativas americanas y africanas, así como entre hombres africanos y mujeres nativas americanas. Además, se pudo discernir una ascendencia nativa americana distinta en la población amazónica, además del flujo de genes sesgado por el sexo entre la Amazonía y las regiones de los Andes y la costa del Pacífico. En general, estos resultados subrayan la importancia de integrar la información del cromosoma X para lograr una visión más completa de las historias genéticas y demográficas de las poblaciones mixtas de América del Sur.

El artículo se titula: “Investigating genetic diversity in admixed populations from
Ecuador”

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Nueva publicación de nuestros graduados y docentes en revista científica internacional

Christian Bilvao graduado  y Daniela Santander docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

La pandemia de COVID-19 ha desafiado los sistemas de salud pública en todo el mundo, afectando particularmente a países en desarrollo en América Latina como Ecuador. En este informe, fue expuesto el papel fundamental de las universidades ecuatorianas para mejorar la vigilancia de COVID-19 en el país, con una contribución global superior al 15% del total de pruebas RT-PCR de SRAS-CoV-2 realizadas.

Se destaca el papel de la UDLA durante el primer semestre de la pandemia COVID-19, contribuyendo a una prueba masiva gratuita de SARS-CoV-2 hasta casi el 10% del diagnóstico total completado en el país, enfocado principalmente en áreas urbanas y rurales desatendidas. y comunidades indígenas.

Finalmente, se describe la contribución a un diagnóstico de RT-PCR de SARS-CoV-2 de alta calidad y bajo costo en Ecuador.

El artículo se titula: “Crucial contribution of the universities to SARS-CoV-2 surveillance in Ecuador: Lessons for developing countries

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