Vinicio Armijos, Eduardo Tejera y Yasel Guerra docentes de Ingeniería en Biotecnología,  publicaron su trabajo de investigación.

La familia de inhibidores de tripsina de soja Kunitz (Kunitz-STI) es una gran familia de proteínas y la mayoría de sus miembros son inhibidores de proteasa. La versatilidad del perfil inhibidor y la plasticidad estructural de estas proteínas hacen de esta familia un andamio prometedor para el diseño de nuevas proteínas multifuncionales. Históricamente, los inhibidores de Kunitz-STI se han clasificado como inhibidores canónicos de serina proteasa, pero en los últimos años se han descrito nuevos inhibidores con nuevos mecanismos de inhibición. Diferentes mecanismos de inhibición podrían ser el resultado de diferentes vías evolutivas. En el presente trabajo, se ha realizado un análisis estructural de todas las estructuras cristalográficas disponibles para los inhibidores de Kunitz-STI para caracterizar las características y ubicaciones estructurales del bucle de unión de serina proteasa.

El estudio sugiere una relación entre la conformación de los bucles de unión de serina proteasa y el mecanismo de inhibición, su ubicación en el pliegue del trébol β y la fuente vegetal de los inhibidores. Los inhibidores canónicos clásicos de esta familia están restringidos a plantas del orden Fabales y se unen a sus objetivos a través del bucle β4-β5, mientras que los bucles de unión a serina proteasa en inhibidores de otras plantas se encuentran principalmente en los bucles β5-β6 y β9-β10. Además, se encontró que el bucle β5-β6 se utiliza para inhibir dos familias diferentes de serina proteasas a través de un mecanismo de inhibición del bloqueo estérico. Este trabajo ayudará a cambiar la percepción general de que todos los inhibidores de Kunitz-STI son inhibidores canónicos y las proteínas con bucles de unión a proteasas que adoptan conformaciones no canónicas son excepciones. Además, estos resultados ayudarán en la identificación de bucles de unión a proteasas en inhibidores no caracterizados o recientemente descubiertos, y en el diseño de proteínas multifuncionales.

El artículo se titula: “Canonical or noncanonical? Structural plasticity of serine protease-binding loops in Kunitz-STI protease inhibitors”

Para poder conocer todos los resultados obtenidos, haga clic aquí.

Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Sebastián Atarihuana, Jennifer Gallardo Condor y Rodrigo Flores Espinoza, graduados de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación

La deficiencia de glucosa-6-fosfato deshidrogenasa (G6PDd) es un trastorno ligado al cromosoma X que afecta a más de 400 millones de personas en todo el mundo. Los individuos con variantes moleculares asociadas con una actividad enzimática reducida son susceptibles al estrés oxidativo en los glóbulos rojos, lo que aumenta el riesgo de afecciones fisiopatológicas y toxicidad de los tratamientos antipalúdicos. A nivel mundial, la prevalencia de G6PDd varía entre las poblaciones. En consecuencia, este estudio tiene como objetivo caracterizar la distribución de G6PDd dentro de la población ecuatoriana y describir la distribución espacial de los casos de malaria reportados.

Se genotiparon variantes moleculares asociadas con G6PDd en 581 individuos de grupos étnicos afroecuatorianos, indígenas, mestizos y montubios. Además, se realizó un análisis espacial para identificar grupos importantes de malaria con altas tasas de incidencia en todo Ecuador, utilizando datos recopilados de 2010 a 2021.

Las variantes A- c.202G > A y A- c.968T > C sustentan la base genética de G6PDd en la población estudiada. La prevalencia general de G6PDd fue del 4,6% en toda la población. Sin embargo, esta frecuencia aumentó al 19,2% entre los afroecuatorianos. El análisis espacial reveló 12 grupos de malaria, ubicados principalmente en el norte del país y su región amazónica, con riesgos relativos de infección de 2,02 a 87,88.

Los hallazgos de este estudio tienen implicaciones significativas para las intervenciones de salud pública, las estrategias de tratamiento y los esfuerzos específicos para mitigar la carga de la malaria en Ecuador. La alta prevalencia de G6PDd entre los grupos afroecuatorianos en las áreas endémicas del norte requiere el desarrollo de estrategias integrales de erradicación de la malaria adaptadas a esta región geográfica.

El artículo se titula: “Genetic basis and spatial distribution of glucosa-6-phosphate dehydrogenase deficiency in Ecuadorian ethnic groups: a malaria perspective”

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Andres Ambuludí  graduado y Vinicio Armijos Docente de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

El síndrome respiratorio agudo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) es un virus emergente que, desde marzo de 2020, ha sido responsable de una pandemia global y en curso. Su rápida propagación durante los últimos tres años ha provocado la aparición de nuevas variantes. Para monitorear la circulación y aparición de variantes del SARS-CoV-2 se requieren sistemas de vigilancia basados en mutaciones de nucleótidos.

En este sentido, se ha buscado en los genes de pico, ORF8 y nucleocápside para detectar sitios variables entre las variantes del SARS-CoV-2. Describieron regiones genéticas polimórficas que nos permiten diferenciar entre las variantes preocupantes (VoC) Alfa, Beta, Gamma, Delta y Omicron. Encontrando 21 mutaciones relevantes, 13 de las cuales son únicas para los linajes Omicron BA.1/BA.1.1, BA.2, BA.3, BA.4 y BA.5. Este perfil genético permite la discriminación entre VoC utilizando solo cuatro fragmentos de PCR con transcripción inversa y secuenciación Sanger, ofreciendo una alternativa más barata y rápida a la secuenciación del genoma completo para la vigilancia del SARS-CoV-2.

El artículo se titula: “A tool for the cheap and rapid screening of SARS-CoV-2 variants of concern (VoCs) by Sanger sequencing”

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David Vasco Julio, María Huilca Ibarra, Yanua Ledesma y  Salome Guerrero Freire graduadas de Biotecnología y Carlos Bastidas Caldéz, docente de Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Se ha desarrollado un sistema de PCR múltiple (m-PCR) para diferenciar con precisión las cinco especies patógenas de Prototheca más importantes , incluidas las tres especies asociadas con la infección en el ganado lechero ( P. ciferrii , P. blaschkeae y P. bovis ) y las dos especies asociadas con infecciones humanas ( P. wickerhamii y P. cutis ). El método es de bajo costo ya que emplea un método simple de “choque térmico” en un tampón TE para la extracción de ADN. Además, solo requiere cebadores, una polimerasa Taq, un gel de agarosa y un marcador de peso molecular para su identificación.

El método se basó en la publicación Prototheca.secuencias del citocromo B y se evaluó utilizando cepas de referencia de cada una de las cinco especies de Prototheca . La validez del método se confirmó mediante la identificación de 50 cepas aisladas de muestras de leche. La especificidad se probó in silico y con pruebas experimentales de PCR, y no mostró reacciones cruzadas con otras especies de Prototheca , así como con bacterias, hongos, vacas, algas, animales o humanos. El método podría detectar infecciones mixtas que involucren a dos o tres especies de Prototheca , proporcionando una prueba rápida que arroja resultados en tres horas.

El artículo se titula: “The Development of a Multiplex PCR Assay for Fast and Cost-Effective Identification of the Five Most Significant Pathogenic Prototheca Species”

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Biotecnología Industrial

Se abre la convocatoria para pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-1 en la materia de Biotecnología Enzimática.

Los requisitos son los siguientes:

• Carta de intención
• Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en las materias de Química-Física y Biotecnología Enzimática y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
• CV actualizado.

Las carpetas digitales serán receptadas al correo maria.cruz.salazar@udla.edu.ec con copia a carlos.moyota.tello@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el viernes  11 de agosto, 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Biotecnología Vegetal

Se abre la convocatoria para pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-1 con la en la materia de Biotecnología Vegetal.

Los requisitos son los siguientes:

• Carta de intención
• Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en la materia de Fisiología Celular y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
• CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo fernando.rivas@udla.edu.ec con copia a carlos.moyota.tello@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el viernes 11 de agosto, 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Biotecnología Molecular

Se abre la convocatoria para pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-1 con la en la materia de Ingeniería Genética.

Los requisitos son los siguientes:

• Carta de intención
• Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en la materia de Ingeniería Genética y al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
• CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo carlos.moyota.tello@udla.edu.ec con copia a maria.granja@udla.edu.ec y mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el domingo 3 de septiembre, 5 pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Biotecnología Aplicada

Se abre la convocatoria para prácticas pre-profesionales en las vacaciones intersemestre y semestre 2024-1 con la en la materia de Proyecto Integrador.

Los requisitos son los siguientes:

• Carta de intención
• Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener como mínimo una nota de 8/10 en las materias de Fenómenos de transporte aplicados a la Biotecnología y Bioestadística y al menos 8 en el promedio general de la carrera.
• CV actualizado

Las carpetas digitales serán receptadas al correo carlos.moyota.tello@udla.edu.ec  y hasta el viernes 11 de agosto, 5pm.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas con fecha a confirmar.

Unidad de innovación Tecnológica

Se abre la convocatoria para pasantías en el semestre 2024-1 en la unidad de innovación tecnológica

Los requisitos son los siguientes:

• Carta de intención
• Record académico actualizado, en el cual el alumno deberá tener  al menos 7.5 en el promedio general de la carrera.
• CV actualizado.

Las carpetas digitales serán receptadas al correo carlos.moyota.tello@udla.edu.ec con copia a mariaantonella.zambrano@udla.edu.ec hasta el día viernes 14 de julio 10 am.

Los seleccionados pasarán a una segunda etapa de entrevistas, el 17  de julio.

Estimada Comunidad,

Para conocer los horarios 2023-20 definidos por la carrera de Ingeniería en Biotecnología en todos los semestres, por favor revisen el siguiente documento:

Carga 202320

David Vasco graduado y  Carlos Bastidas  docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

El virus de la estomatitis vesicular (VSV) es un arbovirus que causa estomatitis vesicular (VS) en el ganado. Hay dos serotipos reconocidos: New Jersey (VSNJV) e Indiana (VSIV). El virus puede transmitirse directamente por contacto o por vectores.

En 2018, Ecuador experimentó un brote de Estomatitis Vesicular (EV) en bovinos, causado por VSNJV y VSVIV, con 399 casos notificados distribuidos en 18 provincias. Se determinó las relaciones filogenéticas entre 67 cepas. Para la construcción de árboles filogenéticos se secuenció el gen de la fosfoproteína viral y se construyeron árboles con base en el método de Máxima Verosimilitud utilizando cepas del brote de 2004 de Ecuador (GenBank) y las secuencias de 2018 (este artículo). Se construyó una red de haplotipos para VSNJV para rastrear el origen de las epizootias de 2004 y 2018 a través de topologías y conexiones de mutación.

Estos análisis sugieren dos orígenes diferentes, uno relacionado con el brote de 2004 y el otro con una fuente de transmisión en 2018. Este análisis también sugiere diferentes patrones de transmisión; varios brotes pequeños e independientes, muy probablemente transmitidos por vectores en la Amazonía, y otro brote causado por el movimiento de ganado en las regiones andina y costera. Se recomienda más investigación sobre vectores y reservorios vertebrados en Ecuador para aclarar los mecanismos del resurgimiento del virus.

El artículo se titula: “Molecular Tracking of the Origin of Vesicular Stomatitis Outbreaks in 2004 and 2018, Ecuador”

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Fernanda Hernandez graduada y Pablo Castillejos y  Carlos Bastidas  docentes de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Las bacterias multirresistentes presentan mecanismos de resistencia frente a los antibióticos β-lactámicos, como las enzimas betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y metalo-β-lactamasas (MBL), que son operones codificados en especies gramnegativas. Asimismo, las bacterias Gram-positivas han desarrollado otros mecanismos a través de los genes mec, que codifican proteínas fijadoras de penicilina modificadas (PBP2).

Este estudio tuvo como objetivo determinar la presencia y propagación de genes de resistencia a antibióticos β-lactámicos y el microbioma que circula en el Transporte Público de Quito (QTP). Se tomaron muestras de un total de 29 torniquetes de estación para extraer el ADN ambiental de la superficie. Se realizaron PCR para detectar la presencia de 13 genes de resistencia a antibióticos y para identificar y amplificar 16S rDNA para códigos de barras, seguido de análisis de clones, secuenciación de Sanger y búsqueda BLAST. Los genes ESBL blaTEM-1 y blaCTX-M-1 y los genes MBL blaOXA-181 y mecA se detectaron a lo largo de las estaciones QPT, siendo blaTEM el más extendido. Se encontraron dos subvariantes para blaTEM-1, blaCTX-M-1 y blaOXA-181.

Casi la mitad de las bacterias circulantes encontradas en las estaciones QPT eran especies comunes de microbiota humana, incluidas las clasificadas por la OMS como patógenos de vigilancia crítica y de alta prioridad. Los genes de resistencia a los antibióticos β-lactámicos prevalecen en todo el QPT. Este es el primer reporte de blaOXA-181 en muestras ambientales en Ecuador. Además, detacteraon una nueva variante putativa de este gen. Algunas bacterias coagulasa negativas comensales pueden desempeñar un papel como reservorios de resistencia a mecA.

El artículo se titula: “Beta-Lactam Antibiotic Resistance Genes in the Microbiome of the Public Transport System of Quito, Ecuador”

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