Ignacio Yepez, Alejandra Garzón y Rodrigo Flores graduados de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

El presente estudio tuvo como objetivo caracterizar la composición genética paterna de la población indígena ecuatoriana. Para investigar un posible sesgo de matización, también se analizaron AIM-InDels. La muestra poblacional de 54 autodeclarados indígenas ecuatorianos presentó una alta diversidad de haplotipos.

Una gran proporción de los linajes masculinos pertenecen a haplogrupos de nativos americanos. Aunque de origen autodeclarado indígena, la muestra poblacional estudiada presentó una baja distancia genética con una muestra de individuos mestizos del Ecuador..

El artículo se titula: “The paternal heritage of self-declared Ecuadorian indigenous people”

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Pueden encontrar éste y otros artículos completos publicados por nuestros estudiantes y docentes en la sección de Publicaciones.

Katherin Barrionuevo, Alejandra Garzón, graduadas y Eduardo Tejera docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI) publicaron su trabajo de investigación.

Encontrar estrategias rápidas y baratas para la tipificación de ADN y la identificación de muestras humanas es de interés en la ciencia forense. En este trabajo se presenta una nueva alternativa versátil para la determinación del sexo molecular utilizando objetivos específicos de Y (TSPY, TTTY, regiones alfoides y Y-Amelogenina). Este sistema utiliza una amplificación de ADN mediada por bucle isotérmico (LAMP) con un conjunto de 6 cebadores para cada objetivo, diseñado para mejorar la sensibilidad y la especificidad, y reducir el tiempo de detección a solo 45 min. Además, la detección de los diferentes objetivos en el cromosoma Y, ya sea individualmente o en combinación, reveló resultados precisos.

La sensibilidad del ensayo se determinó con una mezcla de ADN humano femenino y masculino a diferentes concentraciones para imitar las muestras forenses. Los conjuntos de cebadores individuales mostraron una alta sensibilidad a concentraciones de ADN que oscilaban entre 58,6 y 3,7 pg/µL. Cuando se utilizó un conjunto de cebadores combinados, la sensibilidad arrojó una detección tan baja como 0,1 pg/µL de ADN masculino, lo que lo hace 10 veces más sensible que los kits de cuantificación de qPCR-DNA.

Finalmente, se observó una alta especificidad cuando se probó contra 6 especies domésticas.

El artículo se titula: “High-performance LAMP-based method for human sex identification using Y chromosome-specific genetic markers”

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Se solicitan dos pasantes para el Grupo de Bio-quimioinformática. El tema de trabajo es la identificación de los posibles mecanismos de acción de alcaloides presentes en especies de ranas venenosas. El proyecto es completamente computacional y trabajarán con los profesores Yunierkis Pérez y Yendrek Velásquez.

Requisitos:

• Estar en 4to semestre o superior y como máximo estar iniciando 8vo semestre.
• Conocimientos de bioquímica y preferiblemente haber cursado la materia de bioinformática.

En este proyecto aprenderás sobre bioinformática estructural, estructura de proteínas, interacciones proteína-ligando, y sobre acoplamiento (docking) molecular.

Enviar Curriculum al correo: yendrek.velasquez.lopez@udla.edu.ec

Estimada Comunidad,

Para conocer los horarios 2023-1 definidos por la carrera de Ingeniería en Biotecnología en todos los semestres, por favor revisen el siguiente documento:

Horarios

Andrea Beltrán, Mabel Guevara y John Proaño graduados y Eduardo Tejera docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, publicaron su trabajo de investigación.

Ocimum basilicum y Ocimum tenuiflorum son dos especies de albahaca ampliamente utilizadas en medicina como agentes antiinflamatorio, antimicrobiano y cardioprotector. Este estudio se centra en la caracterización química de los compuestos mayoritarios de ambas especies y su potencial antiinflamatorio. En ambas plantas se identificaron hasta 22 compuestos como diversos tipos de ácidos salvianólicos, derivados del ácido rosmanírico y flavonas. Los compuestos identificados fueron muy similares entre ambas plantas y son consistentes con hallazgos previos en otros estudios en Portugal e Italia.

Sobre la base de las moléculas identificadas se llevó a cabo una predicción de objetivos de consenso. Entre las principales proteínas diana previstas, se encontró una alta representación de la familia de las anhidrasas carbónicas (CA2, CA7 y CA12) y varias proteínas clave de la vía araquidónica (LOX5, PLA2, COX1 y COX2). Ambas vías están bien relacionadas con la inflamación.

La interacción entre los compuestos y estos objetivos se exploró mediante acoplamiento molecular y simulación de dinámica molecular. Los resultados sugieren que algunas moléculas presentes en ambas plantas pueden inducir una respuesta antiinflamatoria a través de un mecanismo de acción no esteroideo relacionado con el metabolismo del dióxido de carbono.

El artículo se titula: ”Metabolomic profile and computational analysis for the identification of the potential anti-inflammatory mechanisms of action of the traditional medicinal plants Ocimum basilicum and Ocimum tenuiflorum ”

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Catherine Armijos graduada y Wilson Tapia docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, publicaron su trabajo de investigación.

Los árboles se han considerado un medio eficaz para evaluar la contaminación por metales en las zonas urbanas. En el trabojo publicado se utilizaron hojas de Callistemon citrininus y Acacia melanoxylon para evaluar la calidad del aire en parques urbanos rodeados de alto tránsito vehicular y en áreas de actividad industrial. Se determinó la concentración de metales (Ca, K, Mg, Fe, Al, Mn, Ba, B, Zn, Cu y Pb) en las hojas y se compararon los resultados entre especies de árboles y tipos de sitio (parques e industrial). Ca, K y Mg se encontraron en concentraciones más altas que los otros metales.

Aunque las diferencias significativas en la concentración de metales entre ambas especies de árboles solo reflejan la composición de la planta en sí, Acacia melanoxylon parece mostrar un mejor desempeño como biomonitor.

De acuerdo con los resultados del factor de contaminación (FC), la mayoría de los sitios fueron clasificados como de contaminación sospechosa, leve o moderada. Además, el análisis de CF y componentes principales indicó que Cu, Zn, Fe y Al resultaron ser los metales más contaminantes en los sitios industriales, mientras que Cu, Pb, Ba y Mn fueron los metales más contaminantes en los sitios del parque.

El artículo se titula:” Assessment of airborne metal pollution in urban parks and industrial areas using Callistemon citrinus and Acacia melanoxylon”

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Estimada Comunidad,

Para conocer los horarios 2022-2 definidos por la carrera de Ingeniería en Biotecnología en todos los semestres, por favor revisen el siguiente documento:

Horarios Semestre 2022-2

Requisitos para realizar la carga del semestre 2022-2:

• Revisar las materias que debe tomar en el blog de la carrera (https://blogs.udla.edu.ec/biotecnologia/carrera/malla-academica/
• Antes de realizar la carga revisar la malla académica de la carrera para verificar que cumple con los prerrequisitos de las materias.
• Cargar primero las materias de los semestres inferiores.
• Es importante tomar la de materia de inglés. Para saber el nivel que deben tomar por favor comunicarse con el departamento de idiomas con el fin de agendar una cita sobre el examen de ubicación.
• Los estudiantes que carguen TITA7442 deben también cargar FGHZ0001.
• Cualquier inconveniente por favor escribir a los correos de Emilia Vásquez (emilia.vasquez@udla.edu.ec) / Andrea Cordero (andrea.cordero@udla.edu.ec), indicando claramente la situación junto con el ID Banner.

Saludos Cordiales,

Fernanda Hernández graduada y Pablo Castillejos docente de la carrera de Ingeniería en Biotecnología, con el apoyo de investigadores de la Dirección General de Investigación (DGI), publicaron su trabajo de investigación.

Los compuestos de fosfonato son la base de muchos contaminantes xenobióticos, como el glifosato (N- (fosfonometil-glicina). Solo los microorganismos procarióticos y los eucariotas inferiores son capaces de biodegradarse con fosfonatos a través de las vías de la C-P liasa.

Se determino la presencia de genes C-P liasa en los sistemas de agua dulce ecuatorianos como un primer paso hacia la evaluación de la presencia de degradadores de glifosato putativos, lo que rompe el enlace CP que es crítico para la mineralización del glifosato. Los ensayos diseñados en este estudio llevaron a la detección de genes phnJ en 7 de 8 cuerpos de agua analizados .

Los fragmentos amplificados presentaron un 85-100% de similitud de secuencia con genes phnJ que pertenecen a microorganismos degradadores de glifosato. Nueve secuencias no fueron reportadas previamente en el GenBank. La presencia de degradadores de fosfonatos se confirmó mediante el aislamiento de tres cepas capaces de gro w utilizando glifosato como fuente de carbono única. Según la secuencia 16S, estas cepas pertenecen a los géneros Pantoea, Pseudomonas y Klebsiella.

Realizar una amplificación por PCR anidada de genes phnJ aislados de cuerpos de agua eutroficados, antes del aislamiento, puede ser una estrategia rentable para la bioprospección de nuevas especies y / o genes que podrían tener nuevas propiedades para las industrias biotecnológicas, sentando las bases para investigaciones adicionales. .

El artículo se titula: “Bioremediation potential of glyphosate-degrading microorganisms in eutrophicated Ecuadorian water bodies”

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Denominación del puesto: Practicante

Dedicación: tiempo parcial / por horas

Remuneración: no disponible

Fecha de inicio: inmediato

Lugar: Pedro Pinto Guzman E7-390, Quito (sector: Pasteurizadora Quito, centro-sur).

Posibilidad de extensión o permanencia: si

Sobre la empresa:

BiologyWorks S.A.S. es una empresa recientemente constituida en la ciudad de Quito, dedicada al desarrollo, formulación, investigación y comercialización de insumos de base biotecnológica, cuya misión es proveer soluciones integrales al sector agroindustrial a través de la producción y comercialización de bioinsumos, que cumplan con los criterios de sostenibilidad en sus tres ejes: ambiente, economía y personas. Para ello, cuenta con un laboratorio de producción fundamentado en la investigación aplicada, en el cual el capital humano representa una parte esencial del proceso, por lo cual la formación profesional del personal y el establecimiento de colaboraciones son de gran interés.

Descripción de deberes y responsabilidades: 

Nota aclaratoria: La gran mayoría de actividades contarán con la dirección y ayuda del personal de la empresa

• Tareas inherentes a la microbiología general, como elaboración de medios de cultivos, crecimiento en medios sólidos y líquidos, manejo de autoclave, entre otros.
• Diseño, optimización e implementación de medios de cultivos utilizando modelos estadísticos
• Desarrollo e implementación de protocolos de formulación a pequeña escala y a escala piloto.
• Búsqueda e interpretación de información en publicaciones científicas
• Manejo de inventarios y elaboración de informes
• Mantener el orden y la limpieza general del laboratorio
• Manejo de un biorreactor a escala piloto
• Ejecución de trámites y elaboración de documentos para la acreditación y registro de productos ante diversas entidades de control
• Escritura de artículos y presentación en congresos científicos

Requisitos:

• Haber cursado y aprobado asignaturas relacionadas a: microbiología general, bioquímica y estadística (indispensable), redacción científica, bioprocesos y control de calidad (deseable, pero no indispensable).
• Tener conocimiento en el manejo de equipos y materiales básicos de laboratorio
• Motivación y perseverancia (indispensable).
• Excelente capacidad de comunicación, tanto escrita como oral (artículos referenciados y elaboración de presentaciones).

Notas adicionales:

BiologyWorsk S.A.S. es una empresa que valora la publicación de resultados ante la comunidad científica. Sin embargo, dada la naturaleza empresarial, nos reservamos los derechos de uso y reproducción de material que sea considerado sensible. Por tal motivo, la empresa solicitará a la persona seleccionada la firma de un acuerdo de confidencialidad, previo al inicio de cualquier actividad de pasantía, práctica pre-profesional, o trabajo de titulación.